Определение микросателлитной нестабильности (MSI) 5 локусов. Рекомедации ESMO_2019. - раздела Молекулярно-генетические исследования в области онкологии

MSI(Microsatellite Instability) Микросателлитная нестабильность связана с нарушением функций генов MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, которые в норме осуществляют репарацию неспаренных нуклеотидов ДНК. Микросателлитная нестабильность является отличительной чертой (характеризует до 90% всех опухолей) синдрома Линча, также встречается в разных пропорциях при спорадических онкологических заболеваниях, в том числе при колоректальном раке, раке эндометрия, желудка, тонкой кишки, уротелиальном раке, опухолях центральной нервной системы и новообразованиях сальной железы. Диагностика MSI проводится по 5-ти генетическим маркерам: BAT-25, BAT-26, NR-21, NR-24, NR-27. В результате проведенного исследования образцу присваивается статус: Высокий (MSI-H), Низкий (MSI-L). Опухоль имеет MSI стабильный (MSS) статус. Метод проведения исследования: сайт- специфическая амплификация специальных участков ДНК (молекулярных маркеров) с детекцией результатов флуоресцентной ПЦР методом капиллярного электрофореза.

Определение статуса MSI рекомендовано международными и российскими профессиональными сообществами: NCCN, ESMO, Ассоциацией онкологов России, Российским обществом клинической онкологии (RUSSCO): При колоректальном раке: 1. Определение дальнейшей тактики лечения после хирургического лечения локализованных стадий; 2. Определение прогноза при 2 стадии; 3. Применение иммунотерапии при метастатической болезни; 4. Подтверждение диагноза синдром Линча. При раке шейки матки, раке яичников, раке поджелудочной железы, раке предстательной железы: 1. Для определения возможности назначения иммунотерапии. При раке эндометрия (раке тела матки): 1. Для подтверждения диагноза синдром Линча; 2. Для определения возможности назначения иммунотерапии

Для исследования ДНК используется предварительно подготовленный биологический материал (парафиновый блок с образцом ткани). И используются образцы биологического материала двух типов: венозная кровь или буккальный эпителий (соскоб с внутренней поверхности щеки)

Парафиновый блок с образцом ткани  

Непригодны для исследований образцы, приготовленные с использованием фиксаторов: Зенкера, Карнуа, Буэна, В-5, а также обработанные кислыми растворами, декальцифицирующими костную ткань.

По возможности образцы, предназначенные для выделения ДНК/РНК, не окрашивать (допустима окраска только крезилвиолетом).

  Обращаем внимание, что на результаты исследования ДНК могут повлиять следующие факторы:

• в случае недостаточного объема пораженной ткани во взятом образце может быть получен ложноотрицательный результат;
• переливание крови или трансплантация костного мозга, стволовых клеток, органов и тканей, которые проводились в недавнем времени (в данном случае исследование ДНК не рекомендуется проводить в течение, как минимум, 1 месяца после трансплантации или переливания крови);
  
• контаминация образца чужим генетическим материалом (все манипуляции с образцами биологического материала рекомендуется проводить в стерильных перчатках)
  

Тип пробирки: Вакуумная пробирка с ЭДТА

Минимальный объем биологического материала: 2 мл (допускается прием пробирок объемом 4-6 мл)

Процедура взятия биологического материала: взятие крови осуществляют из вены в положении пациента сидя или лежа. Кровь должна поступать свободным током непосредственно в вакуумную пробирку с ЭДТА (фиолетовая крышка). После взятия крови пробирку следует плавно перевернуть 5-10 раз для перемешивания с антикоагулянтом.

Центрифугирование: не требуется

Условия хранения: хранение биологического материала следует осуществлять при температуре +2…+8℃ (допускается накапливание биоматериала в заданном температурном режиме до 7 календарных дней). При более длительном хранении кровь необходимо заморозить при температуре -18…-23℃

Условия транспортировки: транспортировку биологического материала следует осуществлять при температуре +2…+8℃ в специальном термоконтейнере с хладагентом (синяя коробка). Замороженный биоматериал – при температуре -18…-23℃ в специальном термоконтейнере с хладагентом (красная коробка).

Не рекомендуется проводить повторное замораживание – оттаивание образцов

Буккальный эпителий (соскоб с внутренней поверхности щеки)

Взятие образцов буккального эпителия осуществляется с внутренней стороны щеки с использованием одноразовых зондов.

Требуется воздержаться от еды, питья, а также курения за полчаса до сбора образцов

Состав набора для взятия буккального эпителия:

• зонд с щеточкой, 2 шт.;
• стерильная емкость для зонда с щеточкой, 2 шт.;
• стерильные одноразовые перчатки, 1 пара;
• индивидуальный zip пакет, 1 шт.

Процедура взятия биологического материала:непосредственно перед взятием образцов необходимо тщательно прополоскать рот чистой водой без использования гигиенических средств для полости рта. Подождите пару минут, чтобы во рту накопилась слюна. Наденьте стерильные перчатки. Аккуратно извлеките зонд из упаковки. Постарайтесь не дотрагиваться до конца зонда с щеточкой. Сделайте щеточкой 10-20 круговых движений по внутренней поверхности обеих щек. Извлеките зонд из ротовой полости, поместите его в стерильную сухую емкость, закройте крышку. Повторите эту процедуру вторым зондом. После взятия второго образца поместите второй зонд во вторую емкость. Обе емкости с зондами поместите в индивидуальный zip-пакет.

У детей, находящихся на грудном вскармливании, образцы следует брать через 30 минут после кормления. Непосредственно перед взятием образца младенцу необходимо дать попить воды из бутылочки.

Для исключения взаимного переноса биологического материала образцы должны храниться в отдельных пробирках и отдельных пакетах

Условия хранения: при температуре +18+25℃

Условия транспортировки:транспортировку биологического материала следует осуществлять при температуре +18+25℃

Для выполнения данного исследования используются образцы ткани, зафиксированные в формалине и заключенные в парафиновый блок

Толщина образца

Оптимальная толщина образца ткани не должна превышать 5 мм

Заливка и фиксация биологического материала

Фиксацию препарата проводить при температуре +4...+10 °С, используя буферный раствор формалина. Процесс фиксации не должен превышать 24 часов (при фиксации ткани в течение 72 часов образуются необратимые сшивки в нуклеиновых кислотах, которые осложняют дальнейшие исследование ДНК/РНК). Соотношение количества формалина к ткани должно быть 10:1. Перед заливкой ткани в парафин нужно убедиться, что образец полностью обезвожен (остаточная вода может вызвать деградацию ДНК/РНК). Для заливки использовать парафин с низкой температурой плавления без примесей.

• По возможности образцы, предназначенные для выделения ДНК/РНК, не окрашивать (допустима окраска только крезилвиолетом).

• Непригодны для исследований образцы, приготовленные с использованием фиксаторов: Зенкера, Карнуа, Буэна, В-5, а также обработанные кислыми растворами, декальцифицирующими костную ткань.

Маркировка

На этикетке должна быть четко и разборчиво нанесена следующая информация, идентифицирующая образец биологического материала:

• фамилия, имя, отчество пациента;

• пол и возраст пациента;

• индивидуальный штрих-код пациента медицинского учреждения, если таковой имеется

Условия хранения

Парафинизированные образцы хранить в течение года при температуре от 0 до +10 °С (допустимо хранение при температуре +10 до +25°С) в специальном контейнере, предотвращающем попадание влаги и механические повреждения, при условии отсутствия попадания прямых солнечных лучей

Условия транспортировки

Транспортировку БМ следует осуществлять при температуре, соответствующей температуре хранения образца, в специальном контейнере, предотвращающем попадание влаги и механические повреждения, при условии отсутствия попадания прямых солнечных лучей

ВНИМАНИЕ!

Во избежание неопределенного результата генетические исследования не проводятся:

• после пересадки костного мозга, стволовых клеток, органов и тканей;
• после процедуры переливания крови в течение 3-х месяцев после проведения процедуры.